Gökhan Günaydın, bir hukukçu, iktisatçı, ziraat mühendisi ve öğretim üyesidir. İstanbul Üniversitesi Hukuk, Anadolu Üniversitesi İktisat ve Atatürk Üniversitesi Ziraat Fakültesi'nden mezun olmuştur. Kamu yönetimi alanında yüksek lisans derecesini Türkiye ve Orta Doğu Amme İdaresi Enstitüsü'nde tamamlamış ve siyaset bilimi doktorası için Ankara Üniversitesi Siyasal Bilgiler Fakültesi'nde eğitim görmüştür.