Manuel Neuer, 27 Mart 1986 tarihinde Gelsenkirchen, Almanya‘da doğmuştur. Tam adı Manuel Peter Neuer’dir. Erkek kardeşi Marcel Verbandsliga’da görev yapan bir hakemdir. Annesi Marita Neuer ve babası Peter Neuer’dir.
Manuel ilk olarak 1991 yılında Schalke 04’ün alt yapısında başladı. 2004 yılına kadar kulübün alt yapı kademelerinin hepsinde forma giydikten sonra 2008 yılına kadar ikinci takımda yer aldı. A takıma ilk kez 2005 yılında çağrılsa da burada forma şansını çok az yakaladı. 2006-2007 sezonunda 27, 2007-2008 sezonunda 44, 2008-2009 sezonunda 31, 2009-2010 ve 2010-2011 sezonu toplamlarında ise 81 maçta forma giydi.
Manuel Neuer, çok uzun süre forma giydiği takımında gösterdiği performans ile birçok Avrupa kulübünün dikkatini çekerken, tercihini Bayern Münih‘ten yana kullandı ve 25 Milyon Euro karşılığında 5 yıllık sözleşmeye imza attı.
Manuel Neuer, 1 Haziran 2011 tarihinde Bayern Münih‘e transfer oldu. 2012-2013 sezonunda takımın birinci kaleci rolündeyken toplamda 50 maça çıktı ve o sezon ligde ve Avrupa’da bir çok kupa kazanma başarısını gösterdi. Sonraki sezonlarda da başarısı devam ettiren Manuel Neuer, takımının kazandığı kupalarda büyük paylara sahip akımının değişilmez oyuncusu olarak gösterildi. 2014-2015 sezonunda kadar Bayern Münih’te 127 maça çıktı.
Manuel Neuer, 2017 yılında Nina Weiss ile evlendi.